Conhecidas antigamente com o nome de Yacu-Rupaj (Águas Quentes Milagrosas) as termas foram utilizadas desde a época prehispánica pelas Incas. A actividade turística nas termas começa a manifestar-se a fins do século XIX, com a construção do primeiro estabelecimento de alojamento em 1884. Em 1932 por iniciativa provincial traça-se o ejido do povo, que constitui hoje o centro da cidade. Em setembro de 1954 as Termas de Rio Fundo foram declaradas município, e em dezembro de 1956 reconhece-lhas como cidade. Com o tempo, Termas de Rio Fundo desenvolveu-se e convertido num importante e reconhecido centro termal.

Uso terapêutico:
A acção termomineralizadora actua directamente em afecciones reumáticas, cardiovasculares, arteriosclerosis, processos metabólicos em general, sistema muscular e articular, e como fonte de energia anti-stress.